Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930449I24RikQ9D5E3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms