Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zcchc13Q9D548 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zcchc13Q9D548 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms