Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms