Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx29Q9D3S3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snx29Q9D3S3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms