Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx20Q9D2Y5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx20Q9D2Y5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms