Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms