Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pramef12Q9D2F1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms