Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhdc8bQ9D2D9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms