Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms