Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms