Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spc24Q9D083 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms