Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd2Q9CZB3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thumpd2Q9CZB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms