Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl55Q9CZ83 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl55Q9CZ83 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms