Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sgo1Q9CXH7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sgo1Q9CXH7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sgo1Q9CXH7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo1Q9CXH7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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