Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Khdc3Q9CWU5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Khdc3Q9CWU5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms