Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CWU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CWU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms