Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms