Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Raver1Q9CW46 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Raver1Q9CW46 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms