Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sycp2Q9CUU3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms