Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud1Q9CUB6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms