Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sft2d3Q9CSV6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sft2d3Q9CSV6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sft2d3Q9CSV6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sft2d3Q9CSV6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sft2d3Q9CSV6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sft2d3Q9CSV6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sft2d3Q9CSV6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sft2d3Q9CSV6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sft2d3Q9CSV6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d3Q9CSV6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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