Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms