Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms