Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim8Q9CQQ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms