Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2Q9CQP2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms