Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NepnQ9CQ76 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms