Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nudcd2Q9CQ48 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd2Q9CQ48 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms