Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
StambpQ9CQ26 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms