Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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