Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg3Q9CPX6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg3Q9CPX6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms