Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt88Q9CPR6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms