Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rrbp1Q99PL5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms