Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim3Q99PE5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim3Q99PE5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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