Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GpnmbQ99P91 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms