Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms