Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco2Q99NF1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms