Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b1Q99NB9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b1Q99NB9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b1Q99NB9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b1Q99NB9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms