Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd1Q99MV1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tdrd1Q99MV1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms