Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms