Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd2bQ99M03 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd2bQ99M03 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms