Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms