Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms