Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf19Q99KJ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf19Q99KJ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms