Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ubxn2aQ99KJ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms