Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms