Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spef1Q99JL1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Spef1Q99JL1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Spef1Q99JL1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Spef1Q99JL1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spef1Q99JL1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms