Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Supt16hQ920B9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt16hQ920B9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms