Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm2Q91YD4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms