Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms