Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms